Γενετική

Αναζητείται γενετική αλληλουχία επόμενης γενιάς για βαθύτερη κατανόηση του COVID-19

Αναζητείται γενετική αλληλουχία επόμενης γενιάς για βαθύτερη κατανόηση του COVID-19

Θα μπορούσε να είναι το μέλλον των διαγνωστικών εξετάσεων για κοινές λοιμώξεις και θα μπορούσε να αποδειχθεί ένα κρίσιμο εργαλείο για την κατανόηση και την καταπολέμηση νέων ιών. Η γενετική ακολουθία της επόμενης γενιάς ή η ακολουθία της επόμενης γενιάς (NGS) γίνεται όλο και πιο συνηθισμένη στην έρευνα, αν και δεν είναι ακόμη ευρέως διαθέσιμη. Στο Σχολείο Ιατρικής του UNC, αποτελεί μέρος μιας ερευνητικής συνεργασίας για την καλύτερη κατανόηση των ιογενών πνευμονικών λοιμώξεων, συμπεριλαμβανομένου του COVID-19 – του νέου κοροναϊού που σαρώνει τον κόσμο.

“Μπορούμε να χρησιμοποιήσουμε το NGS, το οποίο ανιχνεύει όλους τους ιούς σε ένα δεδομένο δείγμα από έναν ασθενή, για να βεβαιωθεί ότι οι τρέχουσες δοκιμές λειτουργούν σωστά για τον εντοπισμό του ιού COVID-19”, δήλωσε ο Dirk Dittmer, Ph.D. , διευθυντής της UNC Viral Genomics Core και μέλος του Ολοκληρωμένου Καρκίνου του Lineberger.

Το NGS όχι μόνο αναγνωρίζει όλα τα ιούς που υπάρχουν σε ένα δείγμα, αλλά ακολουθεί ή αποκωδικοποιεί το DNA του ιού. Έχοντας τη δυνατότητα να κοσκινίσει μέσω του γονιδιωματικού κώδικα ενός ιού δίνει μια εικόνα για το πόσο παλιό είναι, από πού προέρχεται και αν είναι μεταλλαγμένο.

“Είναι σαν να πάρουμε ένα δακτυλικό αποτύπωμα του ιού”, δήλωσε ο Dittmer. “Μπορούμε να βοηθήσουμε να μάθουμε πολλά πράγματα, συμπεριλαμβανομένου του γιατί μερικοί άνθρωποι αρρωσταίνουν από το ιό και άλλοι δεν το κάνουν”.

Οι τυποποιημένες διαγνωστικές εξετάσεις που χρησιμοποιούνται για την ταχεία ανίχνευση λοιμώξεων από γρίπη ή αναπνευστικές παθήσεις φαίνονται μόνο για περιορισμένο αριθμό προκαθορισμένων ιών και δεν παρέχουν πληροφορίες πέραν των θετικών ή αρνητικών αποτελεσμάτων. Το ίδιο ισχύει και για τις δοκιμές που αναπτύχθηκαν για τη διάγνωση του COVID-19. Η δοκιμή που αναπτύχθηκε από τους ερευνητές του UNC αναζητά ένα τμήμα της γονιδιακής αλληλουχίας του ιού που προκαλεί το νέο coronavirus.

“Επειδή βλέπουμε μόνο μία ακολουθία γονιδίων για τον ιό, πρέπει να παρακολουθούμε συνεχώς για αλλαγές σε αυτή τη σειρά γονιδίων ώστε να είμαστε σίγουροι ότι η δοκιμασία μας είναι ακόμα αξιόπιστη” δήλωσε η Melissa Miller, Ph.D., διευθυντής του UNC Medical Center of Microbiology και Μοριακών Μικροβιολογικών Εργαστηρίων. “Το NGS θα μας βοηθήσει να το κάνουμε αυτό”.

Οι Miller και Dittmer συνεργάζονται για να διατηρήσουν όσο το δυνατόν ακριβέστερα τις δοκιμές COVID-19. Αφού η UNC έχει περάσει από τη διαδικασία επιβεβαίωσης του FDA για δοκιμή – τα πρώτα πέντε θετικά και τα πρώτα πέντε αρνητικά αποτελέσματα που επιβεβαιώθηκαν από το εργαστήριο δημόσιας υγείας της Ν. Καρολίνα – τα πρώτα θετικά 100 δείγματα θα πάνε στο εργαστήριο του Dittmer για περαιτέρω μελέτες αλληλουχίας. «Βοηθάει σίγουρα τη γενική γνώση που έχουμε για την ασθένεια COVID-19 και τις συνθέσεις άλλων οικογενειών που μπορεί να υπάρχουν εκεί», δήλωσε ο Miller.

Διαβάστε όλες τις τελευταίες Ειδήσεις για την υγεία από την Ελλάδα και τον Κόσμο

Διαβάστε Eπίσης:

Πώς η γενετική παραλλαγή προκαλεί διαφορές στη μαθηματική ικανότητα

Εντοπίστηκαν 102 γονίδια που σχετίζονται με τον αυτισμό

Αποκαλύφθηκαν οι γονιδιακές μεταλλάξεις που καθορίζουν το ύψος

Η μεγαλύτερη γενετική μελέτη σε ασιατικό πληθυσμό σχετικά με το ύψος αποκάλυψε πρόσφατα δεκάδες σπάνιες μεταλλάξεις του DNA στους ανθρώπους αυτής της καταγωγής. Τα ευρήματα, που δημοσιεύθηκαν στο Nature Communications, συμπληρώνουν τις γνώσεις των επιστημόνων σχετικά με τις πολύπλοκες αλληλεπιδράσεις μεταξύ των γονιδίων που συμβάλλουν στη φυσιολογική ανάπτυξη και υπογραμμίζουν κάποιες από τις ομοιότητες και […]

Ποιες γενετικές παραλλαγές σχετίζονται με το άγχος

Μια τεράστια ανάλυση γονιδιώματος περίπου 200.000 στρατιωτικών βετεράνων στις ΗΠΑ εντόπισε έξι γενετικές παραλλαγές που σχετίζονται με το άγχος, αναφέρουν ερευνητές από το Yale στο American Journal of Psychiatry. Η νέα μελέτη συμβάλλει περαιτέρω στην πρώτη πειστική μοριακή εξήγηση για το λόγο για τον οποίο συχνά συνυπάρχουν άγχος και κατάθλιψη. “Αυτό είναι το πλουσιότερο σύνολο […]

Πως προκύπτουν καταστροφικές αυτοάνοσες αντιδράσεις

Το ανοσοποιητικό σύστημα χρησιμοποιεί τα μιτοχόνδρια του για να αυτο-διεγείρει τις έμφυτες και προσαρμοστικές αποκρίσεις σε λοίμωξη. Τα αντιδραστικά είδη οξυγόνου (ROS), το ανοσογονικό μιτοχονδριακό DNA (mtDNA) και ακόμη και ολόκληρα μιτοχόνδρια κινητοποιούνται τοπικά σε μια ευαίσθητη ισορροπία για να δημιουργήσουν καυτά σημεία φλεγμονώδους δράσης. Όταν ο φυσιολογικός περιορισμός της ανάδρασης σε αυτές τις διεργασίες […]

Η επεξεργασία γονιδίων ικανή να αποτρέψει διαταραχές του εγκεφάλου

Νέα έρευνα σε ποντίκια υποδηλώνει ότι η επεξεργασία γονιδίων θα μπορούσε να αποτρέψει τις αναπτυξιακές διαταραχές του εγκεφάλου. Η επεξεργασία Epigenome είναι ένας τρόπος αλλαγής της έκφρασης ή της ανάγνωσης των γονιδίων χωρίς να αλλοιωθεί ο υποκείμενος κώδικας DNA τους. Μια ομάδα από το πανεπιστήμιο Johns Hopkins στη Βαλτιμόρη, MD, οδήγησε τη μελέτη Nature Communications […]

Το «ανεπιθύμητο DNA» επηρεάζει τον κληρονομικό κίνδυνο καρκίνου

Ο κίνδυνος ενός ατόμου να αναπτύξει καρκίνο επηρεάζεται από γενετικές παραλλαγές σε περιοχές του DNA που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες, οι οποίες προηγουμένως απορρίφθηκαν ως «σκουπίδια DNA», σύμφωνα με νέα έρευνα που δημοσιεύθηκε στο British Journal of Cancer. Αυτή η νέα μελέτη δείχνει ότι ο κληρονομικός κίνδυνος για καρκίνο δεν επηρεάζεται μόνο από μεταλλάξεις στα βασικά γονίδια […]

Οι γενετικές αλληλουχίες που μας οδηγούν στη γήρανση

Η θεωρία των ελεύθερων ριζών κυριάρχησε στην επιστήμη της γήρανσης στη δεκαετία του 1990 και στις αρχές της δεκαετίας του 2000. Αλλά στη συνέχεια αρκετές μελέτες άρχισαν να αντικρούουν τη θεωρία. Όταν τα ζώα, όπως οι σαλαμάνδρες και τα ποντίκια, είχαν σιωπηλά αντιοξειδωτικά γονίδια (τα αντιοξειδωτικά είναι ουσίες που καταστρέφουν τις ελεύθερες ρίζες), αυτό δεν […]

Νέα γενετική ανάλυση βελτιώνει τη διάγνωση της γνωστικής έκπτωσης

Η αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να διαγνώσει την νοητική αναπηρία με μεγαλύτερη ακρίβεια από άλλες μεθόδους γενετικής ανάλυσης, σύμφωνα με ερευνητές της έκθεσης Karolinska Institutet στο επιστημονικό περιοδικό Genome Medicine. Η αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος χρησιμοποιώντας αναλυτικά εργαλεία που αναπτύχθηκαν από τους ερευνητές θα εισαχθεί τώρα για κλινική διάγνωση πρώτης γραμμής […]

Γονιδιακή θεραπεία αντιμετωπίζει πολλαπλές ασθένειες

Μια νέα μελέτη από το Wyss στο Πανεπιστήμιο του Χάρβαρντ και το Harvard Medical School (HMS) αναφέρει ότι μία μόνο χορήγηση ενός αδενο-συναφούς ιού (AAV) -με βάση γονιδιακή θεραπεία που συνδυάζει τρία γονίδια  μακροζωίας πετυχαίνει σημαντική βελτίωση ή πλήρη αναστροφή πολλαπλών ασθενειών  που σχετίζονται με την ηλικία, υποδηλώνοντας ότι μια προσέγγιση σε επίπεδο συστημάτων για […]