Ερευνητές του Πανεπιστημίου της Καλιφόρνια στο Κέντρο για την Μικροβιολογική Καινοτομία (CMI) του San Diego διαπίστωσαν ότι η δειγματοληψία της μικροβιακής χλωρίδας του εντέρου με την πάροδο του χρόνου μπορεί να προσφέρει πληροφορίες που δεν είναι διαθέσιμες σε ένα μόνο χρονικό σημείο. Τα ευρήματα θα μπορούσαν να βοηθήσουν τους ιατρούς και τους ερευνητές να προσδιορίσουν με μεγαλύτερη ακρίβεια αν ένας ασθενής έχει νόσο Crohn. Τα ευρήματά τους δημοσιεύτηκαν στο ιατρικό περιοδικό Gut.
Οι ερευνητές λένε ότι η ιδέα για την εργασία τους προέρχεται από μια πρόσφατα δημοσιευμένη μελέτη σχετικά με την αστάθεια των μικροβίων του εντέρου ασθενών με νόσο Crohn . “Είναι δύσκολο να αποκτήσουμε μια χρήσιμη εικόνα συλλέγοντας ένα μόνο δείγμα κοπράνων και αυτή η ιδιότητα είναι πιθανό να εμποδίζει την ικανότητά μας να το πράξουμε”, δήλωσε ο επικεφαλής συγγραφέας της μελέτης και ερευνητής στο εργαστήριο του διευθυντή του κέντρου Rob Knight, Yoshiki Vázquez-Baeza.
Σύμφωνα με τον Vázquez-Baeza, όλοι έχουμε μικροοργανισμούς που αλλάζουν συνεχώς, αλλά τα άτομα με νόσο Crohn φαίνεται να έχουν μικρόβια που μεταβάλλονται πολύ συχνότερα. Αυτός και η ομάδα του αναρωτήθηκαν, αν θα μπορούσαν να πραγματοποιήσουν δειγματοληψία του μικροβιώματος με την πάροδο του χρόνου ώστε να μορφοποιήσουν έναν νέο τρόπο ταξινόμησης της νόσου.
Επιπλέον, θα μπορούσε ένας υπολογιστικός αλγόριθμος να χρησιμοποιήσει αυτήν την αυξημένη μεταβλητότητα ως «ενδεικτική» για τη διάκριση μεταξύ ασθενών και μη-ασθενών; Για να διερευνήσουν αυτά τα ερωτήματα, οι ερευνητές συγκέντρωσαν καθημερινά δείγματα κοπράνων από συνολικά 31 άτομα. Σύμφωνα με τον Knight, επίσης καθηγητή στα Τμήματα Παιδιατρικής και Επιστήμης/Τεχνολογίας Υπολογιστών του Πανεπιστημίου του Σαν Ντιέγκο, οι ερευνητές πιστεύουν ότι αυτή είναι η διαχρονική μελέτη της νόσου του Crohn με την πυκνότερη δειγματοληψία.
Μετά τη συλλογή δειγμάτων, οι ερευνητές δημιούργησαν ένα υπολογιστικό μοντέλο για να αποκτήσουν γνώσεις από τα δεδομένα. Όταν χρησιμοποιήθηκαν πολλαπλά δείγματα κοπράνων ανά άτομο, το μοντέλο ήταν σε θέση να προβλέψει αν κάποιος είχε νόσο του Crohn ακόμη καλύτερα από τα δείγματα βιοψίας, τα οποία είναι πιο ακριβά και άβολα στη συλλογή. Η μεθοδολογία επαναλήφθηκε και τα αποτελέσματα επαναλήφθηκαν σε μια δεύτερη ομάδα.
Σύμφωνα με τον Vazquez-Baeza, τα αποτελέσματα υπογραμμίζουν τη σημασία της θεραπείας της νόσου του Crohn ως μίας χρονικά μεταβαλλόμενης κατάστασης, ακόμη και κατά την κλινική ύφεση. Τι έπεται; “Η μελέτη αυτή σε μια μεγαλύτερη ομάδα θα ήταν ένα θαυμάσιο επόμενο βήμα”, δήλωσε ο Vázquez-Baeza. «Ελπίζουμε να δούμε εάν τα ευρήματά μας ισχύουν σε αρκετά ετερογενείς πληθυσμούς και αν τα ίδια τα χαρακτηριστικά είναι σταθερά».