Αναστάτωση έχει προκαλέσει η μη σταθερή θέση του ΕΟΠΠΥ για την διαδικασία συνταγογράφησης φαρμάκων καθώς έχει εκδώσει σε μία εβδομάδα δύο εγκύκλιους .
Συγκεκριμένα, η πρώτη εγκύκλιος αναφέρει ότι απαγορεύεται οι γιατροί να αναγράφουν στη συνταγή μαζί με τη δραστική ουσία και την εμπορική ονομασία του φαρμάκου. Στην δεύτερη διορθωτική εγκύκλιο και μετά από πιέσεις του Πανελληνίου Ιατρικού Συλλόγου και άλλων φορέων ο ΕΟΠΥΥ επιτρέπει, χωρίς να το κάνει ξεκάθαρο, στους γιατρούς να αναγράφουν την εμπορική ονομασία του φαρμάκου μόνο στο βιβλιάριο ασθενείας του ασφαλισμένου. Ενώ, στην ιατρική συνταγή επιτρέπεται η αναγραφή μόνο της δραστικής ουσίας. Στους γιατρούς που δεν θα ακολουθούν την συγκεκριμένη οδηγία θα τους αφαιρείται το δικαίωμα συνταγογράφησης για τους ασφαλισμένους του ΕΟΠΥΥ. Η διοίκηση του οργανισμού στην εγκύκλιο συνιστά στους φαρμακοποιούς να λαμβάνουν υπόψη τη δραστική ουσία χορηγώντας το φθηνότερο σκεύασμα χωρίς να επηρεάζονται από την αναγραφή εμπορικού σκευάσματος στο βιβλιάριο του ασφαλισμένου.