Όπως η δράση προκαλεί αντίδραση, έτσι και καμία μεταρρυθμιστική κίνηση της κυβέρνησης δεν θα μπορούσε να περάσει αναίμακτα. Ο λόγος για τη νέα τιμολόγηση φαρμάκων που έχει προξενήσει ποικίλες αντιδράσεις, ιδίως από την πλευρά του Πανελλήνιου Ιατρικού Συλλόγου, των Ιατρικών Συλλόγων Αθηνών και Πειραιά και του Συνδέσμου Φαρμακευτικών Επιχειρήσεων Ελλάδος.
Ειδικότερα, οι Ιατρικοί Σύλλογοι ζητούσαν να ακυρωθούν ως αντισυνταγματικές και παράνομες οι αποφάσεις του υπουργού Υγείας του έτους 2012, που αφορούσαν τον μηχανισμό εφαρμογής της συνταγογράφησης βάσει δραστικής ουσίας και τις εξαιρέσεις από το σύστημα συνταγογράφησης.
Συγκεκριμένα, ο ΙΣΑ με ανακοίνωσή του εξέφραζε τη διαφωνία τους, υποστηρίζοντας ότι η εφαρμογή του μέτρου συνταγογράφησης δραστικής ουσίας «αποτελεί βαρύ επιστημονικό ατόπημα διότι απομακρύνει την ευθύνη της θεραπείας από το γιατρό και τη μεταθέτει στις γκρίζες ζώνες του φθηνού εμπορίου ορισμένων φαρμακοβιομηχανιών» ξένων συμφερόντων.
Εντούτοις, το Συμβούλιο της Επικρατείας απεφάνθη πως η δεν προσκρούει σε καμία συνταγματική και νομοθετική διάταξη, ούτε συνιστά υποβάθμιση της υγείας των Ελλήνων πολιτών, η συνταγογράφηση των φαρμάκων με βάση τη δραστική ουσία, που καθιερώθηκε το 2012 επί υπουργίας Ανδρέα Λοβέρδου.
Παράλληλα, οι γιατροί τόνιζαν ότι η αλλαγή του σκευάσματος, από τρίτους, εκτός του θεράποντος γιατρού, μπορεί να αποβεί μοιραία για την αποτυχία του θεραπευτικού σχήματος και για τη ζωή του ασθενή.