Γενετική

Ερευνητές δημιούργησαν τρισδιάστατο γονιδίωμα

Ερευνητές δημιούργησαν τρισδιάστατο γονιδίωμα

Οι επιστήμονες του St. Jude έχουν χρησιμοποιήσει ένα 3D γονιδίωμα για να βελτιώσουν την κατανόηση της γονιδιακής ρύθμισης κατά τη διάρκεια της ανάπτυξης και της ασθένειας. Δημιούργησαν τον πρώτο 3-D χάρτη ενός γονιδιώματος ποντικού και το χρησιμοποίησαν για να ανακαλύψουν το επιστημονικό οδηγό, ο οποίος περιλαμβάνει τηνεκμάθηση μηχανών στη γονιδιωματική οργάνωση και λειτουργία κατά τη διάρκεια της ανάπτυξης. Η έρευνα εμφανίζεται σήμερα στο περιοδικό Neuron .

«Η κατανόηση του τρόπου με τον οποίο τα κύτταρα οργανώνουν τα γονιδιώματα τους κατά τη διάρκεια της ανάπτυξης θα μας βοηθήσει να κατανοήσουμε την ικανότητά τους να ανταποκρίνονται στο άγχος, τους τραυματισμούς και τις ασθένειες», δήλωσε ο Michael Dyer, Ph.D., πρόεδρος του τμήματος Developmental Neurobiology του St. Jude και Howard Hughes Medical Ερευνητής του Ινστιτούτου.

Η έρευνα επικεντρώθηκε στα κύτταρα ράβδου ανίχνευσης φωτός στον αμφιβληστροειδή ποντικού. Περισσότερα από 8.000 γονίδια ενεργοποιούνται ή απενεργοποιούνται κατά την ανάπτυξη του αμφιβληστροειδούς. Χιλιάδες ρυθμιστικών περιοχών σε ολόκληρο το γονιδίωμα διαδραματίζουν επίσης κάποιο ρόλο. Οι ερευνητές χρησιμοποίησαν την τεχνολογία που ονομάζεται υπερ-βαθιά σύλληψη διαμόρφωσης χρωμοσώματος ή ανάλυση Hi-C για να χαρτογραφήσει αυτές τις αλληλεπιδράσεις σε κύτταρα ράβδου ποντικιού.

Προηγουμένως, η γονιδιωματική 3-D έχει επικεντρωθεί κυρίως στην κατανόηση της ρύθμισης συγκεκριμένων γονιδίων και έχει εργαστεί με κύτταρα που αναπτύσσονται στο εργαστήριο. Χρησιμοποιώντας ολοκληρωμένη ανάλυση δεδομένων από διάφορες πηγές και μηχανική μάθηση, οι ερευνητές έδειξαν ότι η γονιδιωματική οργάνωση άλλαξε με εκπληκτικούς τρόπους σε διαφορετικά στάδια ανάπτυξης. “Αυτές οι αλλαγές δεν είναι τυχαίες αλλά αποτελούν μέρος του αναπτυξιακού προγράμματος των κυττάρων”, δήλωσε ο Dyer.

Διαβάστε όλες τις τελευταίες Ειδήσεις για την υγεία από την Ελλάδα και τον Κόσμο
Ακολουθήστε το healthweb.gr στο Google News και μάθετε πρώτοι όλες τις ειδήσεις

Διαβάστε Eπίσης:

Ο ρόλος της γενετικής στον προσδιορισμό της ανοσίας έναντι της covid-19

Νέο εργαλείο για ευρείες μελέτες γενετικής

svg%3E svg%3E
svg%3E
svg%3E
Περισσότερα

Αναζητείται γενετική αλληλουχία επόμενης γενιάς για βαθύτερη κατανόηση του COVID-19

Θα μπορούσε να είναι το μέλλον των διαγνωστικών εξετάσεων για κοινές λοιμώξεις και θα μπορούσε να αποδειχθεί ένα κρίσιμο εργαλείο για την κατανόηση και την καταπολέμηση νέων ιών. Η γενετική ακολουθία της επόμενης γενιάς ή η ακολουθία της επόμενης γενιάς (NGS) γίνεται όλο και πιο συνηθισμένη στην έρευνα, αν και δεν είναι ακόμη ευρέως διαθέσιμη. […]

Εντοπίστηκαν 102 γονίδια που σχετίζονται με τον αυτισμό

Εκατόν δύο γονίδια που σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο εκδήλωσης αυτισμού εντόπισε διεθνής επιστημονική ομάδα στη μεγαλύτερη μέχρι σήμερα μελέτη γενετικής αλληλούχισης των διαταραχών του αυτιστικού φάσματος. Σε άρθρο που δημοσιεύεται στο Cell, αναφέρεται χαρακτηριστικά ότι «επιτεύχθηκε μια σημαντική πρόοδος ως προς τη διάκριση των γονιδίων που σχετίζονται με τις διαταραχές αυτιστικού φάσματος από αυτά που […]

Αποκαλύφθηκαν οι γονιδιακές μεταλλάξεις που καθορίζουν το ύψος

Η μεγαλύτερη γενετική μελέτη σε ασιατικό πληθυσμό σχετικά με το ύψος αποκάλυψε πρόσφατα δεκάδες σπάνιες μεταλλάξεις του DNA στους ανθρώπους αυτής της καταγωγής. Τα ευρήματα, που δημοσιεύθηκαν στο Nature Communications, συμπληρώνουν τις γνώσεις των επιστημόνων σχετικά με τις πολύπλοκες αλληλεπιδράσεις μεταξύ των γονιδίων που συμβάλλουν στη φυσιολογική ανάπτυξη και υπογραμμίζουν κάποιες από τις ομοιότητες και […]

Ποιες γενετικές παραλλαγές σχετίζονται με το άγχος

Μια τεράστια ανάλυση γονιδιώματος περίπου 200.000 στρατιωτικών βετεράνων στις ΗΠΑ εντόπισε έξι γενετικές παραλλαγές που σχετίζονται με το άγχος, αναφέρουν ερευνητές από το Yale στο American Journal of Psychiatry. Η νέα μελέτη συμβάλλει περαιτέρω στην πρώτη πειστική μοριακή εξήγηση για το λόγο για τον οποίο συχνά συνυπάρχουν άγχος και κατάθλιψη. “Αυτό είναι το πλουσιότερο σύνολο […]

Πως προκύπτουν καταστροφικές αυτοάνοσες αντιδράσεις

Το ανοσοποιητικό σύστημα χρησιμοποιεί τα μιτοχόνδρια του για να αυτο-διεγείρει τις έμφυτες και προσαρμοστικές αποκρίσεις σε λοίμωξη. Τα αντιδραστικά είδη οξυγόνου (ROS), το ανοσογονικό μιτοχονδριακό DNA (mtDNA) και ακόμη και ολόκληρα μιτοχόνδρια κινητοποιούνται τοπικά σε μια ευαίσθητη ισορροπία για να δημιουργήσουν καυτά σημεία φλεγμονώδους δράσης. Όταν ο φυσιολογικός περιορισμός της ανάδρασης σε αυτές τις διεργασίες […]

Η επεξεργασία γονιδίων ικανή να αποτρέψει διαταραχές του εγκεφάλου

Νέα έρευνα σε ποντίκια υποδηλώνει ότι η επεξεργασία γονιδίων θα μπορούσε να αποτρέψει τις αναπτυξιακές διαταραχές του εγκεφάλου. Η επεξεργασία Epigenome είναι ένας τρόπος αλλαγής της έκφρασης ή της ανάγνωσης των γονιδίων χωρίς να αλλοιωθεί ο υποκείμενος κώδικας DNA τους. Μια ομάδα από το πανεπιστήμιο Johns Hopkins στη Βαλτιμόρη, MD, οδήγησε τη μελέτη Nature Communications […]

Το «ανεπιθύμητο DNA» επηρεάζει τον κληρονομικό κίνδυνο καρκίνου

Ο κίνδυνος ενός ατόμου να αναπτύξει καρκίνο επηρεάζεται από γενετικές παραλλαγές σε περιοχές του DNA που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες, οι οποίες προηγουμένως απορρίφθηκαν ως «σκουπίδια DNA», σύμφωνα με νέα έρευνα που δημοσιεύθηκε στο British Journal of Cancer. Αυτή η νέα μελέτη δείχνει ότι ο κληρονομικός κίνδυνος για καρκίνο δεν επηρεάζεται μόνο από μεταλλάξεις στα βασικά γονίδια […]