Γενετική

Πώς να επεξεργαστείτε τα μιτοχόνδρια σας

Πώς να επεξεργαστείτε τα μιτοχόνδρια σας

Η μιτοχονδριακή γενετική μηχανική είναι η προσαρμογή των τεχνικών γενετικής μηχανικής σε συγκεκριμένα μιτοχονδριακά προβλήματα. Αν και δεν είναι συνηθισμένο να γεννιόμαστε με σοβαρά μιτοχονδριακά ζητήματα, όλοι τελικά θα πρέπει να αντιμετωπίσουμε αυτά τα προβλήματα με τη μία ή την άλλη μορφή, υπό την προϋπόθεση ότι θα ζήσουμε αρκετά καιρό.

Ίσως το πιο ισχυρό εργαλείο που διατίθεται σήμερα για τον έλεγχο του κώδικα του μιτοχονδριακού γονιδιώματος είναι η τεχνολογία επεξεργασίας γονιδίων. Το σύστημα CRISPR / Cas9, ειδικότερα, έχει χρησιμοποιηθεί με μεγάλη επιτυχία στο πυρηνικό γονιδίωμα. Δυστυχώς, υπάρχουν διάφοροι λόγοι για τους οποίους το CRISPR είναι προβληματικό για τα μιτοχόνδρια. Για ένα, δεν υπάρχουν πολλές τοποθεσίες στο συγκριτικά μικρό μιτοχονδριακό γονιδίωμα όπου θα μπορούσε να ασκηθεί αποτελεσματικά το CRIPSR. Επιπλέον, δεν υπάρχει σαφώς καθορισμένος μηχανισμός εισαγωγής του οδηγού RNA σε μιτοχόνδρια. Αυτά τα γεγονότα της ζωής κάνουν τους λίγους δημοσιευμένους ισχυρισμούς κάθε επιτυχούς mito-CRISPR μάλλον αμφίβολο.

Μια πολύ πιο ελκυστική επιλογή για την επεξεργασία των μιτοχονδρίων είναι η χρήση νουκλεασών δακτυλίων ψευδαργύρου (ZFNs) που έχουν κατασκευαστεί για να κόψουν δίκλωνο ϋΝΑ σε επιθυμητές θέσεις. Τα ZFN λειτουργούν σε ζεύγη – ένα μέρος στοχεύει το προσβλητικό νουκλεοτίδιο σε ένα σκέλος, ενώ το άλλο μέρος έχει σχεδιαστεί για να δεσμεύει έναν συγκεκριμένο αριθμό νουκλεοτιδίων μακριά στον αντίθετο κλώνο. Αν όλα πάνε καλά, τα δύο μισά τελικά θα διμεριστούν και θα διασπάσουν το DNA.

Ένα φαινομενικό οδόφραγμα είναι ότι η συρραφή στο “σωστό” νουκλεοτίδιο και στη συνέχεια η επισκευή των πραγμάτων είναι δύσκολη, διότι τα μιτοχόνδρια των θηλαστικών δεν κάνουν επισκευή διπλής αλυσίδας πολύ αποτελεσματικά, αν όχι καθόλου. Η ομορφιά της προσέγγισης ZFN είναι ότι δεν χρειάζεται να κάνουμε μια πλήρη επεξεργασία και επισκευή. Οποιαδήποτε μόρια mtDNA με θραύσματα διπλής έλικας διασπώνται και εξαλείφονται σε σύντομη σειράαπό την ενδογενή δραστικότητα νουκλεάσης του PolG, τη μιτοχονδριακή ϋΝΑ πολυμεράση και την MGME1, μια μιτοχονδριακή ενδονουκλεάση που εμπλέκεται στην αντιγραφή του mtDNA.

Το κύτταρο στη συνέχεια ανταποκρίνεται αναλόγως ώστε να επαναφέρει τα επίπεδα του mtDNA σε ισορροπία, αυξάνοντας τις συγκεντρώσεις των νουκλεοτιδίων και εκτυπώνοντας το νέο mtDNA. Ακολούθως, εκτελώντας μονής γονιδιωματικής επεξεργασίας per se, κάποιος επεξεργάζεται πραγματικά τα μιτοχόνδρια σε επίπεδο πληθυσμού για να επιτύχει ένα επιθυμητό επίπεδο ετερόπλασμα μεταξύ διαφορετικών (και όχι απαραίτητα όλων των κακών) γονιδιωμάτων.

Το Payam Gammage, από τη Μονάδα MRC Μιτοχονδριακής Βιολογίας στο Πανεπιστήμιο του Cambridge, και οι συνεργάτες του μόλις ανέφεραν τις πρώτες in vivo επιτυχίες στη χρήση νουκλεασών δακτύλου ψευδαργύρου για την εκλεκτική επιτόπια επεξεργασία παθογόνων mtDNAs σε έναν ετεροπολασμικό μιτοχονδριακό πληθυσμό θηλαστικών. Γράφοντας στο 24ο τεύχος της Φύσης Ιατρικής , επιδεικνύουν τη διόρθωση μίας καρδιακά ειδικής μιτοχονδριακής διαταραχής με ταυτόχρονη θεραπευτική αποκατάσταση μοριακών και βιοχημικών σφραγίδων σε μια κατάσταση άθλιων.

Για να γίνει αυτό, χρησιμοποίησαν ένα μοντέλο ποντικού που περιέχει καλά καθορισμένα επίπεδα ετεροπλασμικής για την μιτοχονδριακή κωδικοποίηση της αλανίνης tRNA. Η σημείωση για αυτή την παραλλαγή διαβάζει το m.5024C> T tRNA (Ala). Επειδή το tRNA της αλανίνης είναι στην πραγματικότητα κωδικοποιημένο στον ελαφρό κλώνο, το RNA καταλήγει να περιέχει ένα Α αντί ενός G στο σημείο 5024. Αυτό πιθανώς δημιουργεί προβλήματα με την αναδίπλωση ή / και την αμινοακυλίωση και οδηγεί σε μειωμένα επίπεδα σταθερής κατάστασης του tRNA. Και στην παραλλαγή ποντικού και στην αντίστοιχη ανθρώπινη παραλλαγή, τα αποτελέσματα αυτά εμφανίζονται πιο έντονα στον καρδιακό ιστό ως κλασική μιτοχονδριακή καρδιομυοπάθεια.

Κάθε μία από τις δύο πρωτεΐνες ZFN χορηγήθηκε συστηματικά στον ποντικό μέσω μιας καρδιοτροπικής έκδοσης του αδενοϊού. Αυτός ο συγκεκριμένος φορέας (ορότυπος16 του AAV9.45) έχει μια μοναδική δομή πρωτεΐνης περιβλήματος που κατά προτίμηση το στοχεύει στην καρδιά έναντι άλλων οργάνων όπως το συκώτι. Η προκύπτουσα μεταβολή στην ετερόπλασμα mtDNA βρέθηκε να είναι ειδική για την καρδιά και ευαίσθητη στην ακριβή δόση, με 5 χ 10 12 ιικά γονιδιώματα ανά μονομερές ανά ποντικό να είναι μια τυπική παροχή.

Το εργαστήριο Moraes στο Μαϊάμι εργάζεται για μια παρόμοια στρατηγική για την επεξεργασία των μιτοχονδρίων. Χρησιμοποιούν διαφορετικά είδη νουκλεασών που ονομάζονται τελεστές ενεργοποίησης μεταγραφικής δράσης (Mito-TALENs) οι οποίες μπορούν να γίνουν για να δεσμευτούν σχεδόν οποιαδήποτε αλληλουχία ϋΝΑ. Αναφέρονται πίσω-πίσω στη Φύση Ιατρική , τα αποτελέσματα του Moraes επιβεβαιώνουν στενά αυτά που έλαβε ο όμιλος Cambridge. Όπως τα ZFNs, τα Mito-TALEN που χρησιμοποιούνται εδώ δεν οδηγούν απαραιτήτως την ετεροποσμία μέχρι το μηδέν. Σε περιπτώσεις και περιοχές όπου υπάρχουν υψηλά επίπεδα μεταλλαγμένης ετεροπλασμίνης, η ξαφνική εξάντληση όλων των τοπικών mtDNA θα ήταν πιθανόν καταστροφική.

Διαβάστε όλες τις τελευταίες Ειδήσεις για την υγεία από την Ελλάδα και τον Κόσμο
Ακολουθήστε το healthweb.gr στο Google News και μάθετε πρώτοι όλες τις ειδήσεις

Διαβάστε Eπίσης:

Ο ρόλος της γενετικής στον προσδιορισμό της ανοσίας έναντι της covid-19

Νέο εργαλείο για ευρείες μελέτες γενετικής

svg%3E svg%3E
svg%3E
svg%3E
Περισσότερα

Αναζητείται γενετική αλληλουχία επόμενης γενιάς για βαθύτερη κατανόηση του COVID-19

Θα μπορούσε να είναι το μέλλον των διαγνωστικών εξετάσεων για κοινές λοιμώξεις και θα μπορούσε να αποδειχθεί ένα κρίσιμο εργαλείο για την κατανόηση και την καταπολέμηση νέων ιών. Η γενετική ακολουθία της επόμενης γενιάς ή η ακολουθία της επόμενης γενιάς (NGS) γίνεται όλο και πιο συνηθισμένη στην έρευνα, αν και δεν είναι ακόμη ευρέως διαθέσιμη. […]

Εντοπίστηκαν 102 γονίδια που σχετίζονται με τον αυτισμό

Εκατόν δύο γονίδια που σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο εκδήλωσης αυτισμού εντόπισε διεθνής επιστημονική ομάδα στη μεγαλύτερη μέχρι σήμερα μελέτη γενετικής αλληλούχισης των διαταραχών του αυτιστικού φάσματος. Σε άρθρο που δημοσιεύεται στο Cell, αναφέρεται χαρακτηριστικά ότι «επιτεύχθηκε μια σημαντική πρόοδος ως προς τη διάκριση των γονιδίων που σχετίζονται με τις διαταραχές αυτιστικού φάσματος από αυτά που […]

Αποκαλύφθηκαν οι γονιδιακές μεταλλάξεις που καθορίζουν το ύψος

Η μεγαλύτερη γενετική μελέτη σε ασιατικό πληθυσμό σχετικά με το ύψος αποκάλυψε πρόσφατα δεκάδες σπάνιες μεταλλάξεις του DNA στους ανθρώπους αυτής της καταγωγής. Τα ευρήματα, που δημοσιεύθηκαν στο Nature Communications, συμπληρώνουν τις γνώσεις των επιστημόνων σχετικά με τις πολύπλοκες αλληλεπιδράσεις μεταξύ των γονιδίων που συμβάλλουν στη φυσιολογική ανάπτυξη και υπογραμμίζουν κάποιες από τις ομοιότητες και […]

Ποιες γενετικές παραλλαγές σχετίζονται με το άγχος

Μια τεράστια ανάλυση γονιδιώματος περίπου 200.000 στρατιωτικών βετεράνων στις ΗΠΑ εντόπισε έξι γενετικές παραλλαγές που σχετίζονται με το άγχος, αναφέρουν ερευνητές από το Yale στο American Journal of Psychiatry. Η νέα μελέτη συμβάλλει περαιτέρω στην πρώτη πειστική μοριακή εξήγηση για το λόγο για τον οποίο συχνά συνυπάρχουν άγχος και κατάθλιψη. “Αυτό είναι το πλουσιότερο σύνολο […]

Πως προκύπτουν καταστροφικές αυτοάνοσες αντιδράσεις

Το ανοσοποιητικό σύστημα χρησιμοποιεί τα μιτοχόνδρια του για να αυτο-διεγείρει τις έμφυτες και προσαρμοστικές αποκρίσεις σε λοίμωξη. Τα αντιδραστικά είδη οξυγόνου (ROS), το ανοσογονικό μιτοχονδριακό DNA (mtDNA) και ακόμη και ολόκληρα μιτοχόνδρια κινητοποιούνται τοπικά σε μια ευαίσθητη ισορροπία για να δημιουργήσουν καυτά σημεία φλεγμονώδους δράσης. Όταν ο φυσιολογικός περιορισμός της ανάδρασης σε αυτές τις διεργασίες […]

Η επεξεργασία γονιδίων ικανή να αποτρέψει διαταραχές του εγκεφάλου

Νέα έρευνα σε ποντίκια υποδηλώνει ότι η επεξεργασία γονιδίων θα μπορούσε να αποτρέψει τις αναπτυξιακές διαταραχές του εγκεφάλου. Η επεξεργασία Epigenome είναι ένας τρόπος αλλαγής της έκφρασης ή της ανάγνωσης των γονιδίων χωρίς να αλλοιωθεί ο υποκείμενος κώδικας DNA τους. Μια ομάδα από το πανεπιστήμιο Johns Hopkins στη Βαλτιμόρη, MD, οδήγησε τη μελέτη Nature Communications […]

Το «ανεπιθύμητο DNA» επηρεάζει τον κληρονομικό κίνδυνο καρκίνου

Ο κίνδυνος ενός ατόμου να αναπτύξει καρκίνο επηρεάζεται από γενετικές παραλλαγές σε περιοχές του DNA που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες, οι οποίες προηγουμένως απορρίφθηκαν ως «σκουπίδια DNA», σύμφωνα με νέα έρευνα που δημοσιεύθηκε στο British Journal of Cancer. Αυτή η νέα μελέτη δείχνει ότι ο κληρονομικός κίνδυνος για καρκίνο δεν επηρεάζεται μόνο από μεταλλάξεις στα βασικά γονίδια […]